Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATG4DQ86TL0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms