Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF554Q86TJ5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms