Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT27Q7Z3Y8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT27Q7Z3Y8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT27Q7Z3Y8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT27Q7Z3Y8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT27Q7Z3Y8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms