Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CATSPER4Q7RTX7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms