Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KNDC1Q76NI1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms