Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACAD11Q709F0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms