Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XIRP1Q702N8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XIRP1Q702N8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP1Q702N8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms