Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM47EQ6ZV65 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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