Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00299Q6ZSB3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms