Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms