Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SDE2Q6IQ49 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDE2Q6IQ49 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms