Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARMIL2Q6F5E8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARMIL2Q6F5E8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms