Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
INTS3Q68E01 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms