Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALS2CLQ60I27 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms