Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHEQ5VZ18 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms