Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAMD13Q5VXD3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms