Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOGA3Q5TF21 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms