Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SAPCD1Q5SSQ6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SAPCD1Q5SSQ6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SAPCD1Q5SSQ6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SAPCD1Q5SSQ6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SAPCD1Q5SSQ6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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