Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms