Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D3Q587I9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms