Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms