Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms