Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTXN3Q4LDR2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN3Q4LDR2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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