Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms