Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms