Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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GEN1Q17RS7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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GEN1Q17RS7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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