Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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RTL8BQ17RB0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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