Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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