Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
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TXNRD1Q16881 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNRD1Q16881 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXNRD1Q16881 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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