Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLPPQ16740 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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