Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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FXNQ16595 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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FXNQ16595 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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FXNQ16595 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXNQ16595 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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FXNQ16595 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FXNQ16595 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXNQ16595 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXNQ16595 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FXNQ16595 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXNQ16595 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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