Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SGCBQ16585 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SGCBQ16585 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SGCBQ16585 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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