Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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ZNF56Q15929 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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ZNF56Q15929 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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ZNF56Q15929 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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ZNF56Q15929 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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ZNF56Q15929 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ZNF56Q15929 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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