Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms