Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDCD1Q15116 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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PDCD1Q15116 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDCD1Q15116 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDCD1Q15116 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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PDCD1Q15116 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDCD1Q15116 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDCD1Q15116 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDCD1Q15116 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDCD1Q15116 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PDCD1Q15116 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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PDCD1Q15116 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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PDCD1Q15116 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDCD1Q15116 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDCD1Q15116 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
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PDCD1Q15116 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDCD1Q15116 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDCD1Q15116 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDCD1Q15116 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PDCD1Q15116 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDCD1Q15116 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PDCD1Q15116 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDCD1Q15116 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDCD1Q15116 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDCD1Q15116 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDCD1Q15116 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PDCD1Q15116 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDCD1Q15116 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDCD1Q15116 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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