Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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