Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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