Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms