Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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