Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
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