Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFIXQ14938 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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