Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN1Q14699 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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