Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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UBE4AQ14139 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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UBE4AQ14139 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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UBE4AQ14139 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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UBE4AQ14139 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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UBE4AQ14139 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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UBE4AQ14139 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE4AQ14139 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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