Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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