Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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