Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMC2Q13753 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMC2Q13753 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMC2Q13753 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMC2Q13753 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms