Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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