Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms