Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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