Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBP1Q13363 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms